L’Institut Supérieur d’Agriculture (ISA) a été créé en 1983 par décret n°100/59 du 06/05/1983. A ce moment il dépendait du Ministère de l’Agriculture et de l’Elevage. En 1989, l’I.S.A a été intégré à l’Université du Burundi fonctionnant dès ce jour comme Faculté , dépendant directement de l’Administration Centrale de cette même Université.
Une des missions principales de l’I.S.A est de former des Ingénieurs Industriels en Agriculture, en Génie Rural, Eaux et Forêts, en Zootechnie et en Technologie des Industries Agro-alimentaires ; dans le but de satisfaire aux besoins croissants de la population.
Sur le plan administratif: l’ISA est dirigé par un Doyen, épaulé par un Vice doyen et un Secrétaire Administratif. De façon générale, l’ISA fonctionne comme une Faculté.Cependant,, ses services sociaux sont assurés par un agent envoyé par la Régie des Œuvres Universitaires de Bujumbura. Du point de vue Académique : Les enseignements s’organisent en quatre départements à savoir : le Département d’Agriculture ; le Département de Génie Rural , Eaux et Forêts ; le Département de Zootecnie ; le Département de Technologies des Industries Agro-alimentaires. En matière de recherche : L’ISA dispose d’une Bibliothèque d’un laboratoire de Biochimie, de Physique, de Génie Rural, d’une ferme didactique et d’un centre vétérinaire.
Administratifs : Un Secrétaire Administratif, le Gérant de la ferme, le Chef du Service Financier(tous de Catégorie de Direction), Cinq Secrétaires dactylographes, Un responsable du personnel de la ferme, Un caissier de la ferme et 6 plantons Scientifiques & techniques : 4 préparateurs Enseignants Trois docteurs à temps plein, Trois Maîtres assistants Un Assistant de recherche, Cinq Assistants en formation Plusieurs enseignants à temps partiel de niveau d’études différents.
L’ISA compte participer à l’élan agricole, sylvicole et zootechnique d’aujourd’hui par une approche plus technique des problèmes afin d’assurer la survie du monde rural.Par ailleurs, pour bien réaliser sa mission principale, l’ISA doit être doté comme tous les autres Campus de l’Université du Burundi d’un site web.